ໂຄງການອອກແບບແລະການແກ້ໄຂຂອງຕ່ອງໂສ້ polypeptide peptide

I. ສະຫຼຸບ
Peptides ແມ່ນ macromolecules ພິເສດທີ່ລໍາດັບຂອງພວກມັນຜິດປົກກະຕິໃນລັກສະນະທາງເຄມີແລະທາງດ້ານຮ່າງກາຍ.peptides ບາງຊະນິດແມ່ນຍາກທີ່ຈະສັງເຄາະ, ໃນຂະນະທີ່ອື່ນໆແມ່ນຂ້ອນຂ້າງງ່າຍທີ່ຈະສັງເຄາະແຕ່ຍາກທີ່ຈະຊໍາລະລ້າງ.ບັນຫາພາກປະຕິບັດແມ່ນວ່າ peptides ສ່ວນຫຼາຍແມ່ນລະລາຍເລັກນ້ອຍໃນການແກ້ໄຂທີ່ມີນ້ໍາ, ດັ່ງນັ້ນໃນການເຮັດຄວາມສະອາດຂອງພວກເຮົາ, ສ່ວນທີ່ສອດຄ້ອງກັນຂອງ peptide hydrophobic ຕ້ອງໄດ້ຮັບການລະລາຍໃນຕົວລະລາຍທີ່ບໍ່ມີນ້ໍາ, ດັ່ງນັ້ນ, ທາດລະລາຍຫຼື buffers ເຫຼົ່ານີ້ມີແນວໂນ້ມທີ່ຈະບໍ່ສອດຄ່ອງກັນຢ່າງຮຸນແຮງກັບການນໍາໃຊ້. ຂອງຂັ້ນຕອນການທົດລອງທາງຊີວະພາບ, ດັ່ງນັ້ນນັກວິຊາການຖືກຫ້າມຢ່າງເຂັ້ມງວດຈາກການນໍາໃຊ້ peptide ສໍາລັບຈຸດປະສົງຂອງຕົນເອງ, ດັ່ງນັ້ນດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້ແມ່ນຫຼາຍດ້ານຂອງການອອກແບບ peptides ສໍາລັບນັກຄົ້ນຄວ້າ.

ໂຄງການອອກແບບແລະການແກ້ໄຂຂອງຕ່ອງໂສ້ polypeptide peptide
ອັນທີສອງ, ທາງເລືອກທີ່ຖືກຕ້ອງຂອງ peptides ຍາກສັງເຄາະ
1. ຄວາມຍາວທັງໝົດຂອງລຳດັບທີ່ຄວບຄຸມລົງ
peptides ຂອງສານຕົກຄ້າງຫນ້ອຍກວ່າ 15 ແມ່ນງ່າຍຕໍ່ການໄດ້ຮັບເພາະວ່າຂະຫນາດຂອງ peptide ເພີ່ມຂຶ້ນແລະຄວາມບໍລິສຸດຂອງຜະລິດຕະພັນ crude ຫຼຸດລົງ.ໃນຂະນະທີ່ຄວາມຍາວທັງຫມົດຂອງລະບົບຕ່ອງໂສ້ peptide ເພີ່ມຂຶ້ນເກີນ 20 residue, ປະລິມານຜະລິດຕະພັນທີ່ຊັດເຈນແມ່ນຄວາມກັງວົນທີ່ສໍາຄັນ.ໃນຫຼາຍໆການທົດລອງ, ມັນງ່າຍທີ່ຈະໄດ້ຮັບຜົນກະທົບທີ່ບໍ່ຄາດຄິດໂດຍການຫຼຸດຈໍານວນການຕົກຄ້າງຕ່ໍາກວ່າ 20.
2. ຫຼຸດຈໍານວນສານຕົກຄ້າງ hydrophobic
Peptides ທີ່ມີຄວາມເດັ່ນຊັດຂອງສານຕົກຄ້າງ hydrophobic, ໂດຍສະເພາະໃນພາກພື້ນ 7-12 residues ຈາກ C-terminus, ປົກກະຕິແລ້ວເຮັດໃຫ້ເກີດຄວາມຫຍຸ້ງຍາກໃນການສັງເຄາະ.ອັນນີ້ຖືກເຫັນວ່າເປັນການປະສົມທີ່ບໍ່ພຽງພໍຢ່າງແນ່ນອນ ເພາະວ່າແຜ່ນ B-fold ແມ່ນໄດ້ຮັບໃນການສັງເຄາະ."ໃນກໍລະນີດັ່ງກ່າວ, ມັນອາດຈະເປັນປະໂຫຍດທີ່ຈະປ່ຽນຫຼາຍກ່ວາສອງສານຕົກຄ້າງໃນທາງບວກແລະທາງລົບ, ຫຼືການໃສ່ Gly ຫຼື Pro ເຂົ້າໄປໃນ peptide ເພື່ອປົດລັອກອົງປະກອບ peptide."
3. ການຫຼຸດຜ່ອນການຕົກຄ້າງ “ຍາກ”
"ມີຈໍານວນ Cys, Met, Arg, ແລະ Try residue ທີ່ໂດຍທົ່ວໄປແລ້ວບໍ່ສາມາດສັງເຄາະໄດ້."ໂດຍທົ່ວໄປແລ້ວ Ser ຈະຖືກໃຊ້ເປັນທາງເລືອກທີ່ບໍ່ແມ່ນທາດອົກຊີເຈນທີ່ Cys.
ໂຄງການອອກແບບແລະການແກ້ໄຂຂອງຕ່ອງໂສ້ polypeptide peptide


ອັນທີສາມ, ປັບປຸງທາງເລືອກທີ່ຖືກຕ້ອງຂອງການລະລາຍໃນນ້ໍາ
1. ປັບຈຸດ N ຫຼື C
ກ່ຽວຂ້ອງກັບ peptides ທີ່ເປັນກົດ (ວ່າ, ຄິດຄ່າລົບຢູ່ທີ່ pH 7), acetylation (N-terminus acetylation, C terminus ສະເຫມີຮັກສາກຸ່ມ carboxyl ຟຣີ) ແມ່ນແນະນໍາໂດຍສະເພາະເພື່ອເພີ່ມຄ່າລົບ.ຢ່າງໃດກໍ່ຕາມ, ສໍາລັບ peptides ພື້ນຖານ (ນັ້ນແມ່ນ, ຄິດຄ່າບວກຢູ່ທີ່ pH 7), amination (ກຸ່ມ amino ຟຣີຢູ່ທີ່ N-terminus ແລະ amination ຢູ່ C-terminus) ແມ່ນແນະນໍາໃຫ້ເພີ່ມຄ່າບວກ.

2. ຫຍໍ້ ຫຼື ຂະຫຍາຍລຳດັບຢ່າງຫຼວງຫຼາຍ

ບາງລໍາດັບມີອາຊິດ amino hydrophobic ຈໍານວນຫຼວງຫຼາຍ, ເຊັ່ນ: Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr ແລະ Ala, ແລະອື່ນໆ, ເມື່ອສານຕົກຄ້າງ hydrophobic ເຫຼົ່ານີ້ເກີນ 50%, ພວກມັນມັກຈະບໍ່ງ່າຍທີ່ຈະລະລາຍ.ມັນອາດຈະເປັນປະໂຫຍດທີ່ຈະຂະຫຍາຍລໍາດັບເພື່ອເພີ່ມທະວີການເພີ່ມເຕີມແລະຂົ້ວທາງລົບຂອງ peptide.ທາງ​ເລືອກ​ທີ​ສອງ​ແມ່ນ​ການ​ຫຼຸດ​ຜ່ອນ​ຂະ​ຫນາດ​ຂອງ​ຕ່ອງ​ໂສ້ peptide ເພີ່ມ​ທະ​ວີ​ການ​ທາງ​ບວກ​ແລະ​ທາງ​ລົບ​ໂດຍ​ການ​ຫຼຸດ​ຜ່ອນ​ການ​ຕົກ​ຄ້າງ hydrophobic ໄດ້​.ດ້ານບວກແລະດ້ານລົບຂອງຕ່ອງໂສ້ peptide ທີ່ເຂັ້ມແຂງກວ່າ, ຄວາມເປັນໄປໄດ້ຂອງປະຕິກິລິຍາກັບນ້ໍາຫຼາຍ.
3. ເອົາສານຕົກຄ້າງທີ່ລະລາຍໃນນໍ້າ
ສໍາລັບຕ່ອງໂສ້ peptide ບາງ, ການປະສົມປະສານຂອງອາຊິດ amino ບາງບວກແລະລົບສາມາດປັບປຸງການລະລາຍນ້ໍາ.ບໍລິສັດຂອງພວກເຮົາແນະນໍາ N-terminus ຫຼື C-terminus ຂອງ peptides ທີ່ເປັນກົດເພື່ອສົມທົບກັບ Glu-Glu.N ຫຼື C terminus ຂອງ peptide ພື້ນຖານໄດ້ຖືກມອບໃຫ້ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນ Lys-Lys.ຖ້າບໍ່ສາມາດວາງກຸ່ມທີ່ຄິດຄ່າໄດ້, Ser-Gly-Ser ຍັງສາມາດຖືກວາງຢູ່ໃນຈຸດ N ຫຼື C.ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ວິທີການນີ້ບໍ່ໄດ້ຜົນໃນເວລາທີ່ທັງສອງດ້ານຂອງຕ່ອງໂສ້ peptide ບໍ່ສາມາດປ່ຽນແປງໄດ້.


ເວລາປະກາດ: 12-05-2023