ລັກສະນະໂຄງສ້າງແລະການຈັດປະເພດຂອງ peptides transmembrane

ມີຫຼາຍຊະນິດຂອງ transmembrane peptides, ແລະການຈັດປະເພດຂອງພວກມັນແມ່ນອີງໃສ່ຄຸນສົມບັດທາງກາຍະພາບແລະເຄມີ, ແຫຼ່ງ, ກົນໄກການດູດຊຶມ, ແລະການນໍາໃຊ້ທາງຊີວະພາບ.ອີງຕາມຄຸນສົມບັດທາງກາຍະພາບແລະທາງເຄມີຂອງພວກມັນ, ເຍື່ອ penetrating peptides ສາມາດແບ່ງອອກເປັນສາມປະເພດ: cationic, amphiphilic ແລະ hydrophobic.peptides ຊຶມ Cationic ແລະ amphiphilic ກວມເອົາ 85%, ໃນຂະນະທີ່ເຍື່ອ hydrophobic penetrating peptides ກວມເອົາພຽງແຕ່ 15%.

1. Cationic membrane penetrating peptide

Cationic transmembrane peptides ແມ່ນປະກອບດ້ວຍ peptides ສັ້ນທີ່ອຸດົມສົມບູນໃນ arginine, lysine, ແລະ histidine, ເຊັ່ນ TAT, Penetratin, Polyarginine, P22N, DPV3 ແລະ DPV6.ໃນບັນດາພວກມັນ, arginine ປະກອບດ້ວຍ guanidine, ເຊິ່ງສາມາດຜູກມັດ hydrogen ກັບກຸ່ມອາຊິດ phosphoric ທີ່ຖືກຄິດຄ່າທໍານຽມທາງລົບຢູ່ໃນເຍື່ອຫຸ້ມເຊນແລະໄກ່ເກ່ຍ transmembrane peptides ເຂົ້າໄປໃນເຍື່ອພາຍໃຕ້ສະພາບຂອງຄ່າ PH ທາງກາຍະພາບ.ການສຶກສາຂອງ oligarginine (ຈາກ 3 R ຫາ 12 R) ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າຄວາມສາມາດໃນການເຈາະເຍື່ອແມ່ນບັນລຸໄດ້ພຽງແຕ່ເມື່ອປະລິມານຂອງ arginine ຕ່ໍາເຖິງ 8, ແລະຄວາມສາມາດໃນການເຈາະເຍື່ອຂອງເຍື່ອເມືອກຄ່ອຍໆເພີ່ມຂຶ້ນດ້ວຍການເພີ່ມປະລິມານຂອງ arginine.Lysine, ເຖິງແມ່ນວ່າ cationic ຄື arginine, ບໍ່ມີ guanidine, ສະນັ້ນໃນເວລາທີ່ມັນມີຢູ່ຢ່າງດຽວ, ປະສິດທິພາບການເຈາະຂອງເຍື່ອຂອງມັນບໍ່ໄດ້ສູງຫຼາຍ.Futaki et al.(2001) ພົບວ່າຜົນກະທົບການເຈາະຂອງເຍື່ອທີ່ດີສາມາດບັນລຸໄດ້ພຽງແຕ່ເມື່ອເຍື່ອເຊນ cationic penetrating peptide ມີຢ່າງຫນ້ອຍ 8 ອາຊິດ amino ຄິດຄ່າບວກ.ເຖິງແມ່ນວ່າອາຊິດ amino ທີ່ຖືກຄິດຄ່າໃນທາງບວກແມ່ນຈໍາເປັນສໍາລັບ peptides penetrative ທີ່ຈະເຈາະເຂົ້າໄປໃນເຍື່ອ, ອາຊິດ amino ອື່ນໆມີຄວາມສໍາຄັນເທົ່າທຽມກັນ, ເຊັ່ນ: ເມື່ອ W14 ປ່ຽນເປັນ F, penetrability ຂອງ Penetratin ສູນເສຍໄປ.

ຊັ້ນພິເສດຂອງ cationic transmembrane peptides ແມ່ນລໍາດັບທ້ອງຖິ່ນຂອງນິວເຄລຍ (NLSs), ເຊິ່ງປະກອບດ້ວຍ peptides ສັ້ນທີ່ອຸດົມສົມບູນໃນ arginine, lysine ແລະ proline ແລະສາມາດຖືກສົ່ງໄປຫາແກນໄດ້ໂດຍຜ່ານສະລັບສັບຊ້ອນຂອງຮູຂຸມຂົນນິວເຄຼຍ.NLSs ສາມາດຖືກແບ່ງອອກຕື່ມອີກເປັນການພິມດຽວແລະສອງ, ປະກອບດ້ວຍຫນຶ່ງແລະສອງກຸ່ມຂອງອາຊິດ amino ພື້ນຖານ, ຕາມລໍາດັບ.ຕົວຢ່າງ, PKKKRKV ຈາກ simian virus 40(SV40) ແມ່ນ NLS ພິມດຽວ, ໃນຂະນະທີ່ທາດໂປຼຕີນຈາກນິວເຄລຍແມ່ນ NLS ພິມສອງເທົ່າ.KRPAATKKAGQAKKKL ແມ່ນລໍາດັບສັ້ນທີ່ສາມາດມີບົດບາດໃນເຍື່ອຫຸ້ມເຊນ.ເນື່ອງຈາກວ່າ NLSs ສ່ວນໃຫຍ່ມີຕົວເລກທີ່ຮັບຜິດຊອບຫນ້ອຍກວ່າ 8, NLSs ບໍ່ແມ່ນ transmembrane peptides ທີ່ມີປະສິດທິພາບ, ແຕ່ພວກເຂົາສາມາດເປັນ peptides transmembrane ທີ່ມີປະສິດທິພາບໃນເວລາທີ່ເຊື່ອມໂຍງ covalently ກັບລໍາດັບ hydrophobic peptide ເພື່ອສ້າງເປັນ peptides amphiphilic transmembrane.

ໂຄງສ້າງ-2

2. Amphiphilic transmembrane peptide

amphiphilic transmembrane peptides ປະກອບດ້ວຍໂດເມນ hydrophilic ແລະ hydrophobic, ເຊິ່ງສາມາດແບ່ງອອກເປັນ amphiphilic ປະຖົມ, amphiphilic α-helical ທີສອງ, β-folding amphiphilic ແລະ prolin-enriched amphiphilic.

ປະເພດປະຖົມ amphiphilic wear peptides ເປັນສອງປະເພດ, ປະເພດທີ່ມີ NLSs covalently ເຊື່ອມຕໍ່ໂດຍລໍາດັບ hydrophobic peptide, ເຊັ່ນ: MPG (GLAFLGFLGAAGSTMGAWSQPKKKRKV) ແລະ Pep - 1 (KETWWETWWTEWSQPKKRKV), ທັງສອງແມ່ນອີງໃສ່ສັນຍານການທ້ອງຖິ່ນຂອງ PKKSV0RKphobic ນິວເຄລຍ. ໂດເມນຂອງ MPG ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບລໍາດັບ fusion ຂອງ HIV glycoprotein 41 (GALFLGFLGAAGSTMG A), ແລະໂດເມນ hydrophobic ຂອງ Pep-1 ແມ່ນກ່ຽວຂ້ອງກັບກຸ່ມທີ່ອຸດົມສົມບູນ tryptophan ທີ່ມີຄວາມໃກ້ຊິດຂອງເຍື່ອສູງ (KETWWET WWTEW).ຢ່າງໃດກໍຕາມ, ໂດເມນ hydrophobic ຂອງທັງສອງແມ່ນເຊື່ອມຕໍ່ກັບສັນຍານທ້ອງຖິ່ນ nuclear PKKKRKV ຜ່ານ WSQP.ປະເພດອື່ນຂອງ peptides amphiphilic transmembrane ຕົ້ນຕໍແມ່ນໄດ້ຖືກແຍກອອກຈາກທາດໂປຼຕີນຈາກທໍາມະຊາດ, ເຊັ່ນ: pVEC, ARF(1-22) ແລະ BPrPr(1-28).

peptides α-helical amphiphilic transmembrane ທີສອງຜູກມັດກັບເຍື່ອຜ່ານα-helices, ແລະ residues ອາຊິດ amino hydrophilic ແລະ hydrophobic ຂອງພວກມັນຕັ້ງຢູ່ເທິງພື້ນຜິວທີ່ແຕກຕ່າງກັນຂອງໂຄງສ້າງ helical, ເຊັ່ນ: MAP (KLALKLALK ALKAALKLA).ສໍາລັບ beta peptide folding type amphiphilic wear membrane, ຄວາມສາມາດໃນການປະກອບເປັນແຜ່ນ beta pleated ແມ່ນສໍາຄັນຕໍ່ຄວາມສາມາດເຈາະຂອງເຍື່ອ, ເຊັ່ນໃນ VT5 (DPKGDPKGVTVTVTVTVTGKGDPKPD) ໃນຂະບວນການຄົ້ນຄ້ວາຄວາມສາມາດເຈາະຂອງເຍື່ອ, ການນໍາໃຊ້ປະເພດ D. - ອາຊິດ amino mutation analogues ບໍ່ສາມາດປະກອບເປັນ beta folded ສິ້ນ, ຄວາມສາມາດ penetration ຂອງເຍື່ອແມ່ນບໍ່ດີຫຼາຍ.ໃນ peptides amphiphilic transmembrane ທີ່ອຸດົມດ້ວຍ proline, polyproline II (PPII) ໄດ້ຖືກສ້າງຕັ້ງຂຶ້ນໄດ້ຢ່າງງ່າຍດາຍໃນນ້ໍາບໍລິສຸດໃນເວລາທີ່ proline ອຸດົມສົມບູນໃນໂຄງສ້າງ polypeptide.PPII ແມ່ນ helix ມືຊ້າຍທີ່ມີ 3.0 ອາຊິດ amino ຕົກຄ້າງຕໍ່ລ້ຽວ, ກົງກັນຂ້າມກັບໂຄງສ້າງ alpha-helix ມືຂວາມາດຕະຖານທີ່ມີ 3.6 ອາຊິດ amino ຕົກຄ້າງຕໍ່ລ້ຽວ.peptides amphiphilic transmembrane ທີ່ອຸດົມໄປດ້ວຍໂປຣລີນລວມມີ bovine antimicrobial peptide 7(Bac7), polypeptide ສັງເຄາະ (PPR)n(n ສາມາດເປັນ 3, 4, 5 ແລະ 6), ແລະອື່ນໆ.

ໂຄງສ້າງ-3

3. Hydrophobic membrane penetrating peptide

hydrophobic transmembrane peptides ປະກອບມີພຽງແຕ່ອາຊິດ amino ທີ່ບໍ່ມີຂົ້ວໂລກ, ມີຄ່າສຸດທິຫນ້ອຍກວ່າ 20% ຂອງຄ່າບໍລິການທັງຫມົດຂອງລໍາດັບອາຊິດ amino, ຫຼືປະກອບດ້ວຍ moieties hydrophobic ຫຼືກຸ່ມເຄມີທີ່ຈໍາເປັນສໍາລັບການ transmembrane.ເຖິງແມ່ນວ່າ peptides transmembrane ຈຸລັງເຫຼົ່ານີ້ມັກຈະຖືກມອງຂ້າມ, ພວກມັນມີຢູ່, ເຊັ່ນ: ປັດໄຈການເຕີບໂຕຂອງ fibroblast (K-FGF) ແລະປັດໄຈການເຕີບໂຕຂອງ fibroblast 12 (F-GF12) ຈາກ sarcoma ຂອງ Kaposi.


ເວລາປະກາດ: 19-03-2023